又一年的夏天来临，在九能带刀（鈴置洋孝 饰）的倡议下，天道道场的伙伴们决定结伴出海旅行，谁知航行中遭遇风暴，众人最终流落孤岛。由于乱马（山口勝平 饰）和八宝斋（永井一郎 饰）的打闹，游艇的修缮工作遥遥无期。正在这时，小霞姐姐神秘失踪，最后连珊璞（佐久間レイ 饰）、小靡、右京也不见踪影。在她们失踪的现场，全部留下一只桃子。背后黑手原来是桃幻乡的幻术王子桃磨，来到小岛上的所有女孩都被掳走成为他的新娘候...

脑子缺根弦儿的九能带刀（鈴置洋孝 饰）路过邪马台古董店，在店内看到了极为珍贵的凤凰蛋。传说只要拥有这枚蛋，便可领会到威力无比的魔剑凤凰剑。为了打败宿敌乱马（山口勝平 饰），成为至高无上的强者，九能强买下凤凰蛋。不过店主（北村弘一 饰）叮嘱，无论如何千万不能将蛋放在头顶，否则将由可怕的事情发生。不幸的是，乱马无意中将蛋放在了九能的头上，一只长相奇怪的鸟儿诞生了。它帮助九能成为足以打败任何对手的强者。...

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开。由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界......

阳光明媚的一天，东都体育场正进行一场东京Spirit和大阪钢巴的精彩足球比赛，江户川柯南（高山南 配音）、灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士以及少年侦探团的伙伴们齐齐到场呐喊助威。城市的另一边，事务所......

故事发生于东京，在全球最大体育盛事WSG即将召开之际，知名企业的高官却接连在赞助商酒会现场遭到绑架，而自新名古屋站至东京的最高时速1000km的真空超导磁悬浮列车也被卷入其中，一场牵动国际目光的重大案......

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，柯南（高山みなみ 配音）等人认定这与8年前朝仓主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修......

目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭......

柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底......

知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人......

Kid has his eyes set on the "Lady of the Sky" jewel aboard Bell 3, the largest airship in the world. However, a mysterious terrorist group called Red Shamu-neko has hijacked the airs...