国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠 配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈 配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。但没有超能力的她根本无法进入，被学院老师鸣海先生（石田彰 配音）救助后，意外地开发了蜜柑的超能力，于是，机缘巧合下，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在...

孤儿哈金（大后寿寿花 配音）从小被神父收养，没想到，表面上光鲜伪善的神职人员背地里却是个以虐待儿童为乐的禽兽。虽然生活在非人的待遇之下，但单纯的哈金从来都没有放弃过可以获得自由的梦想，没想到，这一天，她的梦想竟然成为了现实。当那个名为道子（真木阳子 配音）的美丽女人出现在她的面前时，当哈金坐上她那造型夸张的坐骑时，当身后的警察马不停蹄的追赶她们二人的时，哈金明白，从此以后，她的命运，将完完全全的由...

夜斗（神谷浩史 配音），是个居无定所、打着散工、穿着运动服的落魄神明，既没有神社供奉，连手下的神器也急着跳槽，他却怀着“受万民景仰”的伟大梦想，以五元香油钱为价格，接受各种各样的委托，上至砍妖除魔，下至打扫卫生。就这样，夜斗穿梭于此岸与彼岸，与八百万神明、服侍神明的“神器”、人类以及妖，共同生活在这个光怪陆离的世界中。一天，普通初中女生一岐日和（内田真礼 配音）因意外与夜斗结缘，为此落下了一种奇怪...

故事发生在1999年，那个不详的世纪之末。坐落在深山之中，由于不断的发生灵异事件而被称为“超自然学院”的私立学校里，迎来了它年轻强势的新一任校长——神代玛雅（日笠阳子 配音）。绝对不相信有超自然力量存在的玛雅，此行便是为了调查父亲里奇的死因而来，这样的她，遇见了一位名叫内田文明（水岛大宙 配音）的神秘男子，刚刚登场的内田，便说出了让玛雅吃惊的话语，他居然来自未来的2012年！这个形迹可疑的男子的话...